PacBio 키워드

총 17편 · IF≥10 1편 · 최신순

2026년 05월 07일 (Thu)

First identification of HHV-6 in mesenchymal stromal cells raises safety considerations for cell therapy

Xu C, Zhang L, Li L, et al.

Preprint2026-05-06PacBio

Abstract Background: Mesenchymal stem/stromal cells (MSCs) are increasingly applied in the treatment of graft-versus-host disease, autoimmune disorders, and severe inflammatory conditions, frequently in patients with impaired immune function, where viral safety is a critical conc…

10.21203/rs.3.rs-8863642/v1

2026년 05월 01일 (Fri)

4편 · 하루 전체 보기 →

Haplotype-resolved chromosome-level genome assembly of Schizothorax davidi.IF=5.8

Xie C, Li Y, Zhou Y, et al.

PubMedScientific data2026-04-30PacBio

한글 요약고원 고도 적응과 다배수체 진화 모델인 Schizothorax davidi의 haplotype 분해 염색체 수준 게놈(4n=98)을 PacBio·Hi-C로 어셈블했다. 어류 다배수체와 고도 적응 연구를 위한 핵심 참조 자원으로 활용된다.

10.1038/s41597-026-07328-7

Telomere-to-telomere genome assembly of the wood tiger moth Arctia plantaginis.IF=5.8

Koch EL, Warren IA, Brien MN, et al.

PubMedScientific data2026-04-30PacBio

한글 요약경고색 다형성 모델인 wood tiger moth Arctia plantaginis의 telomere-to-telomere(T2T) 게놈을 조립해 기존 1,000+ 스캐폴드 어셈블리를 대체했다. 색깔 좌위와 다른 형질·선택 시그니처 분석에 정확한 참조를 제공한다.

10.1038/s41597-026-07316-x

Chromosome-level genome assembly of two Chinese wild boars (Sus scrofa).IF=5.8

Wang S, Tu Z, Li L, et al.

PubMedScientific data2026-04-30PacBio

한글 요약중국 두 지역 야생멧돼지(Sus scrofa)의 염색체 수준 게놈 어셈블리를 처음 보고했다. 두 야생멧돼지 게놈은 가축 돼지와의 비교 유전체학, 적응 형질, 보존 유전체 연구의 새 참조가 된다.

10.1038/s41597-026-07336-7

De novo chromosome-level genome assembly and annotation of the Muscovy duck (Cairina moschata).IF=4.2

Ju X, Wang Z, Xu H, et al.

PubMedPoultry science2026-04-16PacBio

한글 요약산업적으로 중요한 머스코비 오리(Cairina moschata)의 de novo 염색체 수준 게놈 어셈블리·주석을 PacBio·Hi-C로 생성했다. 본 자원은 머스코비 오리의 형질·생산 형질 GWAS 및 가금 육종에 핵심 참조 데이터로 활용된다.

10.1016/j.psj.2026.106973

2026년 04월 30일 (Thu)

11편 · 하루 전체 보기 →

Methylome profiles to investigate gene regulation mediated by phase-variable DNA methyltransferases in serogroup B Neisseria meningitidis.IF=0.7

Ascari A, Blakeway LV, Bentley SR, et al.

PubMedMicrobiology resource announcements2026-04-29PacBio

한글 요약PacBio HiFi SMRT 메틸로믹스로 N. meningitidis serogroup B 균주(MC58, B6116/77, M0579)의 phase-variable DNA 메틸트랜스퍼라제(ModA11/A12/D1)에 의한 메틸롬 프로파일을 보고했다. 본 데이터는 phasevarion을 통한 병원성 조절 연구의 자원이 된다.

10.1128/mra.00164-26

Discovery of the Novel HLA-DRB3*01:01:25 Allele Using PacBio Sequencing.IF=2.6

Song W, Yu W, Bai S, et al.

PubMedHLA2026-04-01PacBio

한글 요약PacBio 시퀀싱으로 신규 HLA-DRB3*01:01:25 대립유전자를 발견해 보고했다. 기존 DRB3*01:01:02:08 대비 엑손 2의 단일염기 치환과 인트론 변이를 동반한다.

10.1111/tan.70729

Chromosome level genome assembly of the tea ash wood moth, Agriophara rhombata.IF=5.8

Qu H, Chen Q, Chen L, et al.

PubMedScientific data2026-04-29PacBio

한글 요약차나무 해충 Agriophara rhombata의 첫 염색체 수준 게놈을 PacBio·Hi-C로 조립해 473 Mb·25염색체 어셈블리를 제시했다. 본 자원은 차밭 해충 방제와 곤충 비교게놈학 연구의 기반이 된다.

10.1038/s41597-026-07351-8

Diploid chromosome-level genome assembly of the Amazonian endemic morning glory Ipomoea cavalcantei D.F. Austin.IF=5.8

Canesin LEC, Villaça ST, Magalhães L, et al.

PubMedScientific data2026-04-29PacBio

한글 요약동부 아마존 철광석 노두 고유종 Ipomoea cavalcantei의 1.02 Gb 디플로이드 염색체 수준 참조 게놈을 PacBio HiFi와 Hi-C로 조립해 제시했다. 멸종위기 식물의 보존 유전체학과 적응 형질 연구를 위한 자원으로 가치가 있다.

10.1038/s41597-026-07258-4

A telomere-to-telomere reference genome for Stemona tuberosa.IF=5.8

Wei X, Tang D, Peng Y, et al.

PubMedScientific data2026-04-28PacBio

한글 요약약용식물 Stemona tuberosa의 첫 telomere-to-telomere(T2T) 게놈 어셈블리를 PacBio HiFi·ONT·Illumina·Hi-C 통합으로 생성해 두 haplotype을 모두 분해했다. 약용 활성 천연물 생합성 경로 연구와 약용식물 보존 육종에 핵심 자원이 된다.

10.1038/s41597-026-07266-4

The first chromosomal level genome assembly and annotation of Pareuchiloglanis anteanalis.IF=5.8

Li W, Yu D, Que Y, et al.

PubMedScientific data2026-04-29PacBio

한글 요약고산지대 협곡 환경에 적응한 저서성 담수어 Pareuchiloglanis anteanalis의 첫 염색체 수준 게놈 어셈블리·주석을 PacBio·Hi-C로 수행했다. 이 자원은 어류의 알파인 환경 적응 유전적 기반 연구와 보존 유전체학에 활용될 수 있다.

10.1038/s41597-026-07346-5

The complete chloroplast genome sequence of Lophophora diffusa.IF=0.4

Zhang T, Li N, Cui Z, et al.

PubMedMitochondrial DNA. Part B, Resources2026-04-24PacBio

한글 요약환각 식물 Lophophora diffusa의 완전한 엽록체 게놈(115,689 bp)을 PacBio로 시퀀싱했다. mescaline 풍부 L. williamsii와 형태가 유사하지만 알칼로이드 프로파일이 다른 본 종의 분자 식별 마커를 제공해 법집행에서의 종 동정 문제를 해결할 수 있다.

10.1080/23802359.2026.2658959

Haplotype-resolved genome assemblies of BJ and IMR-90 human fibroblast cell lines reveal extensive structural variation and enable reanalysis of historical sequencing data.IF=16.6

Ranallo-Benavidez TR, Hao Y, Volpe E, et al.

PubMedNucleic acids research2026-04-01PacBio

배경
널리 사용되는 인간 섬유아세포주 BJ와 IMR-90의 페어드 디플로이드 게놈 어셈블리는 부재해, 기존 시퀀싱 데이터 해석에 한계가 있었다.
결과
Oxford Nanopore, PacBio HiFi, Hi-C 데이터로 5.9 및 6.0 Gbp의 염색체 수준 위상 디플로이드 어셈블리를 QV 60 이상으로 생성했다.
구조 무결성 검증을 위한 alignment-free k-mer 기반 도구 KaryoScope를 개발해 컴퓨팅 카리오그램을 생성했다.
T2T-CHM13v2.0 대비 5만 개 이상의 구조변이를 확인했고 대부분 이형접합·세포주 특이적이었다.
BJ에서 16p11.2 좌위에 1 Mbp 동형접합 중복을 새롭게 발견해 정상 카리오타입 세포주에도 임상 의미 있는 미세 재배열이 존재함을 입증했다.
디플로이드 어셈블리에 단읽기·RNA-seq·ChIP-seq 매핑 시 read 정렬과 23–28% read의 haplotype phasing이 향상되었다.
결론
두 세포주의 디플로이드 참조 게놈과 검증 도구를 공개 자원으로 제공한다.
의의
기존 시퀀싱 데이터의 재분석과 정밀 변이·발현 연구의 표준을 한 단계 끌어올린다.

10.1093/nar/gkag333

Comparative Genomics of Transisthmian Damselfishes (Abudefduf saxatilis and A. troschelii).IF=3.4

Tracy CB, Arias CF, Tysall E, et al.

PubMedGenome biology and evolution2026-04-30PacBio

한글 요약중앙아메리카 지협(CAI) 융기 후 형성된 자매종 Abudefduf saxatilis와 A. troschelii damselfish의 비교 게놈 분석을 수행했다. 두 종 사이의 게놈 분기 패턴은 해양 생물 동소적 종분화의 분자적 단서를 제공한다.

10.1093/gbe/evag111

A chromosome-level genome assembly of Rhizopus stolonifer associated with passion fruit flower rot.IF=4.0

Sun J, Chen G, Gardiner DM, et al.

PubMedFrontiers in microbiology2026-04-13PacBio

한글 요약용과(passion fruit) 꽃 부패병원균 Rhizopus stolonifer 분리주 PRFJ02의 염색체 수준 게놈을 PacBio HiFi와 Hi-C로 48.2 Mb 규모로 어셈블했다. 본 자원은 병원성 인자·진화 연구와 작물 보호 전략 개발에 활용될 수 있다.

10.3389/fmicb.2026.1757919

Diagnostic utility of clinical genome reanalysis in rare pediatric disorders using long-read sequencing.IF=3.0

Werren EA, Vats P, Rech GE, et al.

PubMedHGG advances2026-04-27PacBio

한글 요약단읽기 외/전장유전체로 진단되지 않은 희귀 소아 질환에 대해 장읽기 게놈 시퀀싱(LR-GS) 기반 임상 재분석의 진단 효용을 평가했다. 구조변이를 포함한 다수 신규 진단을 확인해 LR-GS가 short-read 진단 미해결 사례의 임상 재분석에 유용함을 보였다.

10.1016/j.xhgg.2026.100620

2026년 04월 29일 (Wed)

1편 · 하루 전체 보기 →

Sensitivity of HiFi long-read genome sequencing for difficult-to-detect pathogenic variants when applied to real-world clinical laboratory samples.IF=9.0

Devaney JM, Chong JX, Lopes PC, et al.

PubMedAmerican journal of human genetics2026-04-27mosaic PacBio

한글 요약단읽기 시퀀싱이 검출에 약한 병원성 변이(VDD)의 임상 진단을 보강하기 위해 PacBio HiFi 장읽기 게놈 시퀀싱을 191명 prober에 적용했다. 자동 파이프라인이 481개 질병 원인 변이 중 479개(99.6%)를 검출했고, 미검출 두 건은 모자이시즘 비율이 낮은 trisomy 18(23%)과 5,594 bp 결실(13%)이었다.

10.1016/j.ajhg.2026.04.001

PacBio 키워드

2026년 05월 07일 (Thu)

First identification of HHV-6 in mesenchymal stromal cells raises safety considerations for cell therapy

2026년 05월 01일 (Fri)

Haplotype-resolved chromosome-level genome assembly of Schizothorax davidi.IF=5.8

Telomere-to-telomere genome assembly of the wood tiger moth Arctia plantaginis.IF=5.8

Chromosome-level genome assembly of two Chinese wild boars (Sus scrofa).IF=5.8

De novo chromosome-level genome assembly and annotation of the Muscovy duck (Cairina moschata).IF=4.2

2026년 04월 30일 (Thu)

Methylome profiles to investigate gene regulation mediated by phase-variable DNA methyltransferases in serogroup B <i>Neisseria meningitidis</i>.IF=0.7

Discovery of the Novel HLA-DRB3*01:01:25 Allele Using PacBio Sequencing.IF=2.6

Chromosome level genome assembly of the tea ash wood moth, Agriophara rhombata.IF=5.8

Diploid chromosome-level genome assembly of the Amazonian endemic morning glory Ipomoea cavalcantei D.F. Austin.IF=5.8

A telomere-to-telomere reference genome for Stemona tuberosa.IF=5.8

The first chromosomal level genome assembly and annotation of Pareuchiloglanis anteanalis.IF=5.8

The complete chloroplast genome sequence of <i>Lophophora diffusa</i>.IF=0.4

Haplotype-resolved genome assemblies of BJ and IMR-90 human fibroblast cell lines reveal extensive structural variation and enable reanalysis of historical sequencing data.IF=16.6

Comparative Genomics of Transisthmian Damselfishes (Abudefduf saxatilis and A. troschelii).IF=3.4

A chromosome-level genome assembly of <i>Rhizopus stolonifer</i> associated with passion fruit flower rot.IF=4.0

Diagnostic utility of clinical genome reanalysis in rare pediatric disorders using long-read sequencing.IF=3.0

2026년 04월 29일 (Wed)

Sensitivity of HiFi long-read genome sequencing for difficult-to-detect pathogenic variants when applied to real-world clinical laboratory samples.IF=9.0

2026년 05월 07일 (Thu)

First identification of HHV-6 in mesenchymal stromal cells raises safety considerations for cell therapy

2026년 05월 01일 (Fri)

Haplotype-resolved chromosome-level genome assembly of Schizothorax davidi.IF=5.8

Telomere-to-telomere genome assembly of the wood tiger moth Arctia plantaginis.IF=5.8

Chromosome-level genome assembly of two Chinese wild boars (Sus scrofa).IF=5.8

De novo chromosome-level genome assembly and annotation of the Muscovy duck (Cairina moschata).IF=4.2

2026년 04월 30일 (Thu)

Methylome profiles to investigate gene regulation mediated by phase-variable DNA methyltransferases in serogroup B &lt;i&gt;Neisseria meningitidis&lt;/i&gt;.IF=0.7

Discovery of the Novel HLA-DRB3*01:01:25 Allele Using PacBio Sequencing.IF=2.6

Chromosome level genome assembly of the tea ash wood moth, Agriophara rhombata.IF=5.8

Diploid chromosome-level genome assembly of the Amazonian endemic morning glory Ipomoea cavalcantei D.F. Austin.IF=5.8

A telomere-to-telomere reference genome for Stemona tuberosa.IF=5.8

The first chromosomal level genome assembly and annotation of Pareuchiloglanis anteanalis.IF=5.8

The complete chloroplast genome sequence of &lt;i&gt;Lophophora diffusa&lt;/i&gt;.IF=0.4

Haplotype-resolved genome assemblies of BJ and IMR-90 human fibroblast cell lines reveal extensive structural variation and enable reanalysis of historical sequencing data.IF=16.6

Comparative Genomics of Transisthmian Damselfishes (Abudefduf saxatilis and A. troschelii).IF=3.4

A chromosome-level genome assembly of &lt;i&gt;Rhizopus stolonifer&lt;/i&gt; associated with passion fruit flower rot.IF=4.0

Diagnostic utility of clinical genome reanalysis in rare pediatric disorders using long-read sequencing.IF=3.0

2026년 04월 29일 (Wed)

Sensitivity of HiFi long-read genome sequencing for difficult-to-detect pathogenic variants when applied to real-world clinical laboratory samples.IF=9.0

Methylome profiles to investigate gene regulation mediated by phase-variable DNA methyltransferases in serogroup B <i>Neisseria meningitidis</i>.IF=0.7

The complete chloroplast genome sequence of <i>Lophophora diffusa</i>.IF=0.4

A chromosome-level genome assembly of <i>Rhizopus stolonifer</i> associated with passion fruit flower rot.IF=4.0